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真核生物
真核生物是所有单细胞或多细胞的、其细胞具有细胞核的生物的总称,它包括所有动、植物、真菌和被规入原生生物的单细胞生物。此外它们的细胞具有细胞骨架来维持其形状和大小。其它细胞中没有细胞核的生物被通称为原核生物。真核生物的另一个特点是它们的细胞在制造蛋白质时可以用同一段染色体制造不同的蛋白质。
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启动子
启动子是DNA模板上专一地与RNA聚合酶结合并决定转录从何处起始的部位,也决定基因的转录效率。许多原核生物都含有这两个重要的启动子区:真核生物的启动子部位与原核生物不同,而且启动转录的活性,除需启动子外,还需某些外加序列。它是在上游更远的位置(但不是位置性的增强子或调控区域),是特定转录因子结合位点。
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DNA复制起点
DNA复制起点不论细胞中只含有一条染色体(原核生物)还是有多条染色体,细胞每次分裂时每一条染色体都要精确地复制一次,也就是构成染色体的DNA分子要复制一次。细菌细胞里的质粒也有自己的复制子,有的受控于细菌细胞而同细菌染色体同步复制,这种质粒称为严紧型质粒;哺乳动物线粒体的D—环突约有500~
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内共生学说
内共生学说是一种关于真核细胞起源的假说。她认为,好气细菌被变形虫状的原核生物吞噬后、经过长期共生能成为线粒体,蓝藻被吞噬后经过共生能变成叶绿体,螺旋体被吞噬后经过共生能变成原始鞭毛。线粒体和叶绿体的核糖体分别与细菌和蓝藻的一致,也是由30S和50S两个亚基组成,这说明细菌和线粒体、蓝藻和叶绿体是同源的。
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魏特克五界系统
魏特克五界系统是德国生物学家海克尔(E.Haeckel)于1886年提出三界学说:植物界(Plantae)、动物界(Animalia)和原生生物界(Protista)。他首先根据核膜结构有无,将生物分为原核生物和真核生物两大类。余下的多细胞真核生物又根据它们的营养类型分为植物界(KingdomPlantae),光合自养;
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小球藻病毒1型
PBCV-1型是目前了解最深入、研究最清楚的真核藻类病毒。PBCV-1的脂类物质主要是卵磷脂和磷脂酰乙酰胺,他们对于病毒粒子的感染功能是必不可少的。结果发现:PBCV-1病毒颗粒具有降解宿主细胞壁的活性,参与其溶壁活性的酶是几丁质酶、壳聚糖酶和β-1,3-葡萄糖苷酶,其中壳聚糖酶的活力高低并不与其裂解活性成正比。
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原核生物
原核生物是一些由无细胞核的细胞组成的单细胞或多细胞的低等生物。此外,有的细菌的细胞壁还有胞壁酸和特殊的脂类化合物。3.真核生物植物细胞的细胞壁是具有一定硬度和弹性的固体结构。其主要成分是纤维素(在初生壁上还有半纤维素和果胶质),它形成了细胞壁的网状框架。在电子显微镜下可以看到这种框架是由微纤丝系统组成。
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鞭毛
鞭毛是一种具有运动功能的细胞小器官,见于原生动物的鞭毛虫类、某些细菌、藻类和真菌的游动孢子和配子、后生动物的精子以及所谓构成鞭毛上皮的细胞。结构最简单的鞭毛可在大肠杆菌等周毛细菌群中见到,纤维是由单一的鞭毛蛋白聚合成一层直径15-20纳米的螺旋管构成,其基部通过称为“钩”(hook)的管状结构与基粒相结合。
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复制
染色体上的复制点是一段由100~有的解链酶与引发酶结合在一起(如大肠杆菌T4噬菌体)。DNA复制有高度的忠实性。经研究,发现DNA聚合酶的3′→5′外切核酸酶活性可以校对新生DNA链的碱基序列并改正其聚合酶活性所造成与模板相应核苷酸的“错配”。如半夏、天南星、白附子、川乌、草乌、何首乌、紫河车、香附。
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翻译
翻译,在繁体中文中通常译作转译,是蛋白质生物合成(基因表达中的一部分,基因表达还包括转录)过程中的第一步。其基本原理是竞争性抑制作用或是共价结合而占据了核糖体的活性位点。tRNA可以识别mRNA上以三个核苷酸为代码的密码子,与它们相配的tRNA上的三个核苷酸被称为反密码子。
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RNAi
概述双链RNA对基因表达的阻断作用被称为RNA干预(RNAinterference,RNAi)双链RNA经酶切后会形成很多小片段,称为siRNA,这些小片段一旦与信使RNA(mRNA)中的同源序列互补结合,会导致mRNA失去功能,即不能翻译产生蛋白质,也就是使基因“沉默”了。结果mRNA也变成了双链RNA,它在Dicer酶的作用下也被裂解成siRNA。
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基因
基因(gene)是遗传的基本单位,指位于染色体上特定座位并可进行自身复制的DNA多肽片段。而两股之间则是依靠两者的碱基成分按互补规律分别配对结合,即腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)借两个氢键连接,鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)借三个氢键连接,形成一条双螺旋梯形结构,故称为DNA双螺旋。
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核膜
核膜(nuclearmembrane,nuclearenvelope)是位于真核生物的核与细胞质交界处的双层结构膜。在高等真核生物的有丝分裂前期,核膜变成与小泡和内质网不能区分的几个断片。核膜内层的内表面上,有一层由多肽物质组成的网架,其作用是保持细胞核的形状和附着染色质纤维;
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遗传因子
基因(gene)是遗传的基本单位,指位于染色体上特定座位并可进行自身复制的DNA多肽片段。而两股之间则是依靠两者的碱基成分按互补规律分别配对结合,即腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)借两个氢键连接,鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)借三个氢键连接,形成一条双螺旋梯形结构,故称为DNA双螺旋。
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转译
中心法则的主要内容之一。即mRNA中的核苷酸排列顺序决定多肽链中氨基酸的排列顺序,遗传信息从前者流向后者,内容未变,而“文字”发生转换,故称“转译”。转译过程包括:已激活的氨基酸和tRNA结合,进入核糖体,通过tRNA上的反密码子与核糖体上的mRNA“对号”,由mRNA上的密码子决定氨基酸依次参入多肽链而合成蛋白质。
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反转录病毒
反转录病毒的DNA插入宿主细胞染色体时,在5’LTR的U3左端和3’端LTR的U5右端各丢失2bp,而在宿主染色体插入位点上生成4~同时,它具有真核生物基因表达时所需的基本功能,例如,启动作用、起始作用和转录物的多聚腺嘌呤加尾作用等。在U3—R分界线处还常有一个反向重复序列,这对终止病毒RNA的合成可能也有重要作用。
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基因文库
基因文库是用DNA重组技术将某种生物的总DNA用特定的限制性内切酶切割成一个个片段,然后将这些片段随机地连接在某些质粒或其他载体上,再将它们转移到适当的宿主细胞中,通过细胞的增殖而构成各个片段的无性繁殖系(克隆),当这些克隆多到可以包括某种生物的全部基因时,这一批克隆的总体就称为该种生物的基因文库。
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DNA复性
DNA的复性指变性DNA在适当条件下,二条互补链全部或部分恢复到天然双螺旋结构的现象,它是变性的一种逆转过程。这表明复性是相当理想的。简单顺序的DNA分子,如多聚(A)和多聚(U)这二种单链序列复性时,互补碱基的配对较易实现。对于原核生物核酸分子,此值可代表基因组的大小及基因组中核苷酸对的复杂程度。
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单拷贝序列
单拷贝序列在单倍体基因组中只出现一次或数次,因而复性速度很慢。单拷贝序列中储存了巨大的遗传信息,编码各种不同功能的蛋白质。现在已经知道,真核生物的结构基因不仅在两侧有非编码区,而且在基因内部也有许多不编码蛋白质的间隔序列(interveningsequences),称为内含子(intron),而编码区则称为外显子(exon)。
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整倍体
整倍体是指染色体数目是单倍体数目的整倍数。三个以上相同的染色体组的细胞或个体称为同源多倍体(autopolyploid)。例如,我国遗传学家鲍文奎从普通小麦同黑麦(Secalecereale)杂交得到的异源八倍体小黑麦(Triticale)中选育出一些品种,具有抗逆能力强、穗大、籽粒的蛋白质含量高、生长优势强等优良性状。
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呼吸链
代谢物在脱氢酶的作用下,脱落的氢原子不能直接与氧结合成水,而需要一系列传递体的传递。真核生物的呼吸链在线粒体内膜上,原核生物的呼吸链在细胞质膜上。呼吸链主要成分有烟酰胺脱氢酶的辅酶NAD或NADP,黄素脱氢酶类的辅基FMN或FAD,泛醌或辅酶Q,铁硫蛋白类,细胞色素b、c1、c、aa3等。某些细菌利用维生素K代替辅酶Q。
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单链结合蛋白
单链结合蛋白是又称为双螺旋稳定蛋白(helixdestabilizingprotein)。当解旋酶将双链打开以后,单链DNA具有一种潜在的恢复原来双链的能力,重新形成氢键。SSB对于细菌复制叉的结构的作用和解旋酶是同等的。这可能因为(1)SSB之间的相互作用;(2)第一个SSB和DNA的结合改变了DNA的结构。真核生物的SSB则不表现协同效应。
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双螺旋稳定蛋白
单链结合蛋白是又称为双螺旋稳定蛋白(helixdestabilizingprotein)。当解旋酶将双链打开以后,单链DNA具有一种潜在的恢复原来双链的能力,重新形成氢键。SSB对于细菌复制叉的结构的作用和解旋酶是同等的。这可能因为(1)SSB之间的相互作用;(2)第一个SSB和DNA的结合改变了DNA的结构。真核生物的SSB则不表现协同效应。
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复制叉式复制
复制叉式复制大肠杆菌等原核生物的环状染色体DNA复制时,首先在DNA的复制起点上解螺旋。此时,先由DNA引物酶合成与后随链亲链的碱基互补的、长约10个核苷酸的RNA引物,在DNA聚合酶作用下沿着后随链模板合成DNA,一直延伸到前一个DNA片段5’端上RNA引物为止。最后由DNA连接酶把冈崎片段连接成一条连续的DNA单链。
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反转录转座子
除反转录病毒外,反转录转座子可以分成两类:一类是病毒超家族(viralsuperfamily),这类反转录转座子编码反转录酶或整合酶(integrases),能自主地进行转录,其转座的机制同反转录病毒相似,但不能像反转录病毒那样以独立感染的方式进行传播;
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重复序列家族
重复序列家族(sequencefamily)是指一类核苷酸序列高度相似的重复序列,这些重复序列包括基因和基因以外的序列。真核生物基因组中来源相同、结构相似、功能相关的一组基因可归为一个基因家族(genefamily)。重复序列主要是基因以外的DNA序列。根据其在基因组中的组织形式,可分为串联重复序列和散在重复序列。
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转录酶
转录酶基因转录是以DNA为模板,在依赖于DNA的RNA聚合酶的催化作用下,将4种核苷酸合成RNA。在真杆菌中只有一种,负责mRNA、tRNA和rRNA的合成。大肠杆菌RNA聚合酶由多个亚基组成,全酶(holoenzyme)是α2β'βσ,相对分子质量约480000。
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应答元件
应答元件(responseelement)是位于基因上游能被转录因子识别和结合,从而调控基因专一性表达的DNA序列,如热激应答元件(heatshockresponseelement,HSE)、金属应答元件(metalresponseelement,MRE)、糖皮质激素应答元件(glucor-ticoidresponseelement,GRE)和血清应答元件(serumresponseelement,SRE)等。
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真核生物蛋白激酶
真核生物中发现的蛋白激酶很多,根据其底物蛋白被磷酸化的氨基酸残基种类,可将它们分为5类,即①丝氨酸/苏氨酸(Ser/Thr)蛋白激酶:蛋白质的羟基被磷酸化;②酪氨酸(Tyr)蛋白激酶:蛋白质的酚羟基作为磷受体;⑤天冬氨酰基/谷氨酰基蛋白激酶:以蛋白质的酰基为磷受体。
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反转录酶
反转录酶(Reversetranscripatase)是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。这种酶需要镁离子或锰离子作为辅助因子,当以mRNA为模板时,先合成单链DNA(ssDNA),再在反转录酶和DNA聚合酶Ⅰ作用下,以单链DNA为模板合成“发夹”型的双链DNA(dsDNA),再由核酸酶S1切成二条单链的双链DNA。
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酵母双杂交系统
双杂交系统的建立得力于对真核生物调控转录起始过程的认识。在酵母的有性生殖过程中涉及到两种配合类型:a接合型和α接合型,这两种单倍体之间接合(mating)能形成二倍体,但a接合型细胞之间或α接合型细胞之间不能接合形成二倍体。在含有5-FOA的完全培养基上“诱饵”和“猎物”的相互作用则抑制细胞的生长。
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转录调控区数据库
转录调控区数据库(TRRD)是在不断积累的真核生物基因调控区结构-功能特性信息基础上构建的。每一个TRRD的条目里包含特定基因各种结构-功能特性:转录因子结合位点、启动子、增强子、静默子、以及基因表达调控模式等。TRRDFACTORS(包括TRRD中与各个位点结合的调控因子的具体信息);
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蛋白质直系同源簇数据库
蛋白质直系同源簇(COGs)数据库是对细菌、藻类和真核生物的21个完整基因组的编码蛋白,根据系统进化关系分类构建而成。COG库对于预测单个蛋白质的功能和整个新基因组中蛋白质的功能都很有用。利用COGNITOR程序,可以把某个蛋白质与所有COGs中的蛋白质进行比对,并把它归入适当的COG簇。
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甲病毒属
甲病毒基因组(49SRNA)既可作为mRNA翻译合成非结构蛋白(nsPs),也可作为复制的模板合成负链RNA,负链RNA又是新的病毒基因组和26S亚基因组RNA合成的模板。合成的多聚蛋白经过翻译后切割,生成4种特定的多肽,分别称为nsP1、nsP2、nsP3和nsP4,其中nsP2的C端有蛋白酶活性,N端与细菌解旋酶同源;
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线粒体
在基质中存在着有关三羧酸循环的各种酶和有关脂肪酸B氧化的各种酶。在嵴和内膜中存在着有关电子传递系统的各种酶和与其共轭的磷酸化酶。线粒体中存在着催化物质代谢和能量转换的各种酶和辅酶,因而供能物质(如糖酵解产物丙酮酸)在线粒体内能得到彻底氧化分解,生成更多的高能磷酸化合物ATP以备细胞其它生命活动需要。
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组蛋白
一般认为由以下5种分子构成(因细胞核的种类不同,有时可更多些):F1或Ⅰ(高赖氨酸,丙氨酸型),F2b或Ⅱb2(高赖氨酸,丝氨酸型),F2a2或Ⅱb1(高丙氨酸,亮氨酸型,高精氨酸、赖氨酸型),F2a1或Ⅳ(高精氨酸甘氨酸型)F3或Ⅲ(高精氨酸,丙氨酸型)。染色质中的组蛋白与DNA的含量之比为1:1。
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微孢子虫
微孢子虫感染引起的临床症状和体征均无特异性,例如感染脑炎微孢子虫属的虫种后,患者出现头痛、喷射性呕吐,并可致眼部及肝、肾病变,发病者以艾滋病者人多见;HIV感染或艾滋病患者中微孢子虫的发病率为7%~50%不等,我国的发病率也有增加,故微孢子虫病作为一重要的机会致病原虫病应得到更多的重视。
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藻类学
藻类学Phycology或algology,属于植物学学科中的一门,内容是关于藻类的研究。多数藻类是生存在潮湿的环境里的真核生物,能行光合作用有机体。也有许多藻类是多细胞性或聚集生活,这类的藻类可形成较大的体积,(海带)。藻类学还包括原核生物形的藻类的研究,以蓝绿藻(cyanobacteria)为最著名。
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线粒体基因组
线粒体是真核细胞的一种细胞器,有它自己的基因组,编码细胞器的一些蛋白质。
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DNA拓扑异构酶
DNA拓扑异构酶DNAtopoisomerase是催化DNA拓扑学异构体相互转变的酶之总称。Ⅱ型拓扑异构酶,有存在于细菌中的DNA促旋酶、噬菌体T4的拓扑异构酶Ⅱ以及真核细胞中依赖ATP的拓扑异构酶Ⅱ等。真核细胞的拓扑异构酶Ⅰ,参与核小体的形成,细菌的ω蛋白参与转录和某种转位子的插入。
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细胞遗传学
早期的细胞遗传学着重研究分离、重组、连锁、交换等遗传现象的染色体基础以及染色体畸变和倍性变化等染色体行为的遗传学效应,并涉及各种生殖方式如无融合生殖、单性生殖以及减数分裂驱动等方面的遗传学和细胞学基础。孟德尔定律揭示了以有性生殖为基础的遗传学规律。
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核小体
核小体又称核体、核粒,是染色质的基本结构单位。146个碱基对的DNA包绕在小圆盘外面绕13/4圈。不同组织、不同类型的细胞,以及同一细胞里染色体的不同区段中,盘绕在组蛋白八聚体核心外面的DNA长度是不同的。这些基本功能是由真核生物染色体三种特定的DNA序列所控制,即DNA复制起点、着丝粒和端粒。
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CEN序列
CEN序列centromericsequence是真核生物在有丝分裂和减数分裂时,两个染色体附着的区域,含有11个高度保守的碱基序列:TGATTCCGAA,功能是形成着丝粒,均等分配两个子代染色单体。
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ARS序列
ARS序列autonomousreplicatingsequence即自主复制序列,又叫复制起点序列(replicationoriginsequence)。是顺式作用元件的一种。所有的ARS的DNA均有一段保守序列:200bp#0;A(T)TTTAT(C)A(G)TTTA(T)-200bp,真核生物染色体上有多个ARS序列。上下游各200个bp左右的序列是维持ARS功能所必需的。
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单一序列
单一序列又称非重复序列,在一个基因组中一般只有一个拷贝。真核生物的绝大多数结构基因在单倍体中是单拷贝或几个拷贝(1~5个拷贝)。
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核被膜
核被膜是真核生物的细胞核的最外层结构,由两层单位膜所组成。核被膜的结构比较复杂,它由外核膜、内核膜、核周腔、核孔复合物和核纤层等5个部分组成。外核膜与内核膜相连,表面附有大量的核糖体颗粒。内、外核膜间有15~30nm,的透明腔,称为核周腔,膜上有孔。
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进化方式
进化方式是学者们根据地层中大量的化石资料所概括出来的生物进化过程的类型。如从原核生物到真核生物,从单细胞生物到多细胞生物,从叶状体植物到维管束植物,从裸子植物到被子植物,从无脊椎动物到脊椎动物,以及从鱼纲到两栖纲、爬行纲、鸟纲和哺乳纲的进化等,都是上升进化。镶嵌进化指生物体各种性状进化的速度不同。
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转位因子
转位因子(transposableelement)系在始终保持一定结构下染色体DNA上转位DNA的单位。原核生物的转位因子包含插入序列(IS)、易位子(Tn)和噬菌体Mu等。作为标记基因已发现许多具有对α-氨基苄青霉素和卡那霉素等药物的耐性决定基因。在真核生物中已知在酵母菌、果蝇和玉米等有转位因子。
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超氧化物歧化酶
概述:超氧化物歧化化物歧化酶(SOD)是体内重要的自由基-超氧自由基O2-的天然清除剂,是免除自由基损伤的主要防御酶。相关疾病:精神分裂症、急性心肌梗死、病毒性心肌炎、心肌炎、糖尿病、类风湿性关节炎、蛛网膜下腔出血药品说明书:别名:潘乐新;奥古蛋白;用量用法:肌注:慢性风湿性关节炎,1次8mg,每周3~
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重复序列
高度重复序列DNA通常由简单的核苷酸序列组成,分布在染色体的着丝粒区和端粒区。此外有在反方向上重复的顺序(invertedrepetitiveseq-uence),其变性DNA折叠成发夹结构(hairpinstructure,foldbackstructure,snapbackstru-cture),在编码分析中可迅速再结合的类型。